目前学校设有南方医院、珠江医院、江都医院、中西医结合医院、华瑞医院（原广州市邮电医院）等5所直属附属医院。另有广州军区广州总医院和武汉总医院、南京军区南京总医院和福州总医院4家非直属临床医学院，广东省人民医院、广东省第二人民医院、广东省口腔医院等15家非直属附属医院。

南方医科大学附属医院（临床医学院）一览表

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